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薄层色谱仪是一种经典且成本较低的分离分析手段，在中药鉴定、药物杂质检查、食品添加剂检测等领域仍有广泛应用。与其他色谱技术相比，薄层色谱对水质的宽容度相对较大，但这并不意味着可以忽略纯水质量。
薄层色谱实验用水的场景主要包括：展开剂的配制、固定相的制备（如硅胶板的活化处理）、样品的前处理溶解等。由于薄层色谱以目视或密度扫描方式定性定量，对水中的痕量杂质并不像液相或离子色谱那样敏感，通常使用三级水或二级水即可满足要求。三级水的电阻率一般要求不低于0.2MΩ·cm，二级水则要求不低于1MΩ·cm。对于常规的薄层色谱鉴别实验，采用RO纯水（电阻率0.1-15μS/cm，即0.067-10MΩ·cm）已足够。
配置薄层色谱实验室的纯水设备时，无需追求最高规格的一级超纯水机。选择具备反渗透功能的纯水机，产出RO纯水用于日常实验即可。如果实验室同时还运行液相色谱、离子色谱等对水质要求更高的仪器，可以考虑一机两用型设备——RO纯水供薄层色谱及器皿清洗使用，超纯水供精密分析仪器使用。这种配置方式既满足不同实验需求，又有利于降低运行成本。
辽宁某中药检验实验室主要开展中药材的薄层色谱鉴别工作。该室选用了一台艾柯（AK）唐氏康宁科技公司的一机两用型纯水机，RO纯水用于薄层实验和玻璃器皿冲洗，超纯水则供偶尔开展的液相色谱分析使用。设备运行几年来的实践表明，这种配置方案经济实用，能够满足实验室日常检测需要。
